czwartek, 24 listopada 2011

Proteomika czyli molekularni detektywi na Wydziale Biologii UWM

Proteomika jako dziedzina nauki, narodziła się zupełnie niedawno, w latach 90 XX wieku. Termin proteom pochodzi od angielskiego określenia PROTein complement of the genOME (komponent białkowy kodowany przez genom). Proteomika zajmuje się badaniem białek, ich strukturą, funkcjami i zależności między nimi. Po zbadaniu genomu (zestawu wszystkich genów organizmu), biolodzy molekularni zajęli się badaniem ludzkiego protemu (ale i nie tylko ludzkiego).

Genom jest niezmienny dla danego osobnika, natomiast proteom może się zmieniać. Najprostszym przykładem może być niezmienny genom dla danego gatunku owada oraz opowiadające mu, zdecydowanie różne, proteomy dla postaci larwalnej i dla imaginalnej (dorosłej). Ekolodzy dla tych różnych faz rozwojowych używają pojęcia „ekon”, jako że każde stadium zajmuje inną niszę (czasem inne siedlisko, inna baza pokarmowa itd.).

Proteomika zajmuje się klasyfikowaniem białek, ich identyfikowaniem, charakterystyką, poszukiwaniem różnic między białkami z tkanek normalnych i chorych osób. Ale jest i proteomika funkcjonalna, która zajmuje się wytwarzaniem zupełnie nowych białek i badaniu ich funkcji.

Proteomika łączy szereg technik służących do równoczesnej analizy setek lub tysięcy białek zawartych w komórkach. Rodzi to problemy analizowania jednoczesnego wielu oddziaływujących na siebie obiektów. Podobnie jak w ekologii, gdzie analizuje się w ekosystemie wiele różnych gatunków i wiele oddziaływań między tymi gatunkami oraz między środowiskiem. Mimo różnicy skali niektóre metody analizy w biologii molekularnej jak i ekologii są podobne.

Wyniki badań proteomiki stwarzają nie tylko zupełnie nowe możliwości medyczne, ale wnoszą niezwykle dużo do dyskusji i funkcjonowaniu życia biologicznego, a w konsekwencji także do dyskusji filozoficznych. W wieku XXI biologię znać i rozumieć na podstawowym poziomie musi praktycznie każdy wykształcony człowiek. Z całą pewnością wiek XXI będzie wiekiem biologów, tak jak wiek XX był wiekiem fizyków.

St.Cz.

czwartek, 17 listopada 2011

Jakie są szanse na zatrudnienie po biologii i biotechnologii?

„Rynek pracy niczym żywy organizm reaguje na zmiany zachodzące w światowej gospodarce. (…) Istnieją dwie podstawowe kategorie pracowników, którzy mogą liczyć na większe zainteresowanie pracodawców: są to pracownicy działów sprzedaży (…) a także specjaliści IT [Technologie informatyczne] (…). Jako przyszłościowe wskazać należy również obszar biotechnologii oraz obszar odnawialnych źródeł energii.”

W zakresie odnawialnych źródeł energii potrzebne bedą usługi dotyczące oceny oddziaływania na środowisko, w tym oszacowanie wpływu na różnorodność biologiczną. To szansa dla biologów srodowiskowych. A na Wydzialle Biologii prowadzone sa badania w zakresie np. upraw roslin energetycznych czy wpływu wiatraków. W badaniach tych uczestniczą i studenci.

Jednak zarówno biolog jak i biotechnolog nie powinien zapominać o kształceniu się w zakresie różnorodnych technik informatycznych. To się z pewnością przyda.

Jak zwiększyć swoje szanse na znalezienie pracy? „Studenci powinni skupić się przede wszystkim na zdobywaniu praktyki zawodowej i nabywaniu różnorodnych doświadczeń: staży, praktyk, wymian studenckich. (…) Nie wolno zapominać o tak zwanych umiejętnościach miękkich, czyli tych, które związane są z zarządzaniem, budowaniem relacji czy organizacją pracy.”

Źródło: Beata Pałac „Trendy na rynku pracy, „Eurostudent”, nr 199, październik 2011

poniedziałek, 14 listopada 2011

Molekularne badania chruścików - propozycja studiów doktoranckich w Austrii i USA

Nauka nie zna granic a studia i badania naukowe stają się coraz bardziej międzynarodowe. Studia doktoranckie z zakresu biotechnologii czy biologii molekularnej odbyć można za granicą i to nie martwiąc się o finsnsowanie. Jeśli się ma pomysł na badania, zawsze można znaleźć sensowne możliwości realizacji. Przykładowo zamieszczamy ogłoszenie z Zakładu Limnologii Uniwersytetu Wiedeńskiego.

The Department of Limnology, University of Vienna, is offering a Praedoctoral Research Position for an enthusiastic researcher to work in the field of morphological and molecular Phylogeny of the Trichoptera subfamily Drusinae. As part of a project funded by the Austrian
Science Foundation (FWF), the first cornerstone of the PhD thesis will deal with a morphological data matrix which will be expanded by adding new characters from species currently in our collections not yet fully coded and by additional species collected by separate collecting teams during the project. The expected output will be a complete character matrix
relevant for all existing Drusinae species.

The second cornerstone will consist of phylogenetic analyses of morphological and molecular data sets via parsimony, Bayesian MCMCMC and Maximum likelihood inferences. The expected output of this thesis section will significantly refine the resolution of the phylogenetic relationships of the subfamily known so far. The expected publication effort of the PhD student will also comprise a comprehensive key for all Drusinae species. The PhD candidate will be trained at the Department of Limnology (University of Vienna) by Prof. J. Waringer and by Dr. S. Pauls at the Biodiversity and Climate Research Centre (LOEWE BiK-F), Frankfurt a.M., Germany. In addition, the student will be hosted by Prof. R. Holzenthal in order to get international experience and expert opinion on morphological character coding and homology assessment. The PhD candidate will also participate and coorganize the planned project workshops. The praedoctoral scholar will have plenty opportunities to collaborate with a diverse
group of researchers, including Dr. Wolfram Graf (University of Natural Resources, Vienna, Austria), Prof. M. Kučinić and Dr. A. Previšić (Zoology Department, University of Zagreb, Croatia), Dr. Lujza Ujvárosi (Universitatea Babes-Bolyai, Cluj, Romania) and Dr. Miklos Bálint (Biodiversity and Climate Research Centre (LOEWE BiK-F), Frankfurt, Germany).
We are looking for a highly motivated and self-directed candidate intending to acquire her/his PhD degree at the University of Vienna, and with a strong interest in insect phylogeny, morphology and molecular genetics. Experience in the fields of DNA barcoding, phylogenetic
reconstructions using PAUP*, TNT and Bayesian MCMCMC and maximum likelihood inferences will be appreciated.

Excellent written, verbal and interpersonal skills, and the ability to think creatively and critically are desired. The position is funded for 3 years (half time). Salary is approx. € 16,500 per year (brutto). You may contact and send your application by e-mail to Prof. Johann Waringer (johann.waringer@univie.ac.at). Applications should include a single pdffile containing a CV, a list of publications, a short statement of previous research activities and motivation, and a list of
three references (including contact details).

Applications received before 31 December 2011 will be given full considerations.

czwartek, 10 listopada 2011

Fascynujący świat roślin... na międzynarodowo i globalnie!




18 maja 2012 roku będzie pierwszym dniem międzynarodowej akcji "Fascynujący Świat Roślin".
Rośliny, które gromadzą energię słoneczną w cukrach, są najważniejszymi producentami biomasy. Umiejętność bezpośredniego syntezowania żywności dla własnych potrzeb umożliwiła roślinom skolonizowanie, zaadaptowanie się i rozpowszechnienie niemal wszystkich zakątków naszej planet.


Biologowie oceniają, że na świecie występuje obecnie około 250 000 gatunków roślin. Specjalny dzień poświęcony roślinom, wyznaczony na 18 maja 2012 roku, jest organizowany pod auspicjami Europejskiej Organizacji Nauk o Roślinach (EPSO – European Plant Science Organisation; www.epsoweb.org ), ulokowanej w Brukseli. Życie roślin zawsze zaczyna się od maleńkiego nasiona umieszczonego w glebie. Z niego wyrosnąć może wiele zielonych żyjących istot – od drobnych ziół do wielkich drzew, od kwiatów ozdobnych do roślin uprawnych, od których zależy życie zwierząt i przetrwanie ludzi na planecie Ziemia. Mamy nadzieję, że naszą inicjatywą zasadzimy wiele wirtualnych, lecz stale kiełkujących nasion, które w zbiorowym umyśle europejskich i światowych społeczeństw posieją przekonanie, że nauki o roślinach mają do odegrania kluczową rolę w kształtowaniu teraźniejszego i przyszłego krajobrazu społecznego, środowiskowego i ekonomicznego ludzkości.


Swój udział w dniu „Fascynującego Świata Roślin” zgłosiło już 25 krajów na świecie, lecz wciąż zgłaszają się kolejne. Wszystkie informacje o tym wydarzeniu są dostępne za pośrednictwem strony www.plantday12.eu. Akcję wspiera sieć koordynatorów narodowych, którzy zdecydowali się ofiarować swój czas i energię by promować i rozpowszechniać idee tego wydarzenia w swoich krajach. Jak dotąd ponad 60 instytucji naukowych, uniwersytetów, ogrodów botanicznych i muzeów, wraz z firmami przemysłowymi oraz rolnikami, zgłosiło już gotowość do otwarcia swoich podwojów dla publiczności i przygotowania działań obracających się wokół roślin, w których znajdzie się coś ciekawego dla całych rodzin.


Wszystkich, którzy chcieliby stać się częścią dnia “Fascynującego Świata Roślin” zapraszamy do udziału w wydarzeniu. By zacząć, wystarczy skontaktować się z polskim Koordynatorem Narodowym (patrz niżej) lub Koordynatorem EPSO (kliknąć na "kontakt" na stronie www.plantday12.eu ), by z nimi przedyskutować pomysły, włączyć się do wspólnych działań, oraz uzyskać dostęp do materiałów stanowiących część światowego wizerunku akcji „Fascination of Plants Day”. Zapraszamy do udziału media, a także naukowców, rolników, polityków i przedstawicieli przemysłu, by wspólnie dyskutować o badaniach naukowych prowadzonych na najwyższym poziomie, pokazywać wyniki przełomowych doświadczeń biologii roślin, a także odkryć, jaki potencjał aplikacyjny drzemie w naukach o roślinach. Mamy nadzieję, że w ramach akcji “Fascination of Plants Day” pokazane zostaną wszystkie i bardzo różnorodne zagadnienia związane z roślinami, w tym: badania podstawowe roślin; rolnictwo, ogrodnictwo i leśnictwo; ogrody i ogródki; hodowla roślin; ochrona roślin; żywność i odżywianie; zachowanie środowiska; łagodzenie zmian klimatu; sprytne bioprodukty; bioróżnorodność; zrównoważony rozwój, zasoby odnawialne; oraz edukacja w zakresie poznania roślin, jak i sztuka.

Kontakt w Polsce:
Koordynator Narodowy: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek; Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, ul. Umultowska 89, 61-614 Poznań; tel. 61 829 5972, email: przemow@amu.edu.pl


Od redakcji bloga: będziemy informowali o poczynianiach olsztyńskich naukowców, i przygotowaniach do tego niezwykłego Dnia Roślin.

piątek, 21 października 2011

Pomysł, praca, odkrycie naukowe… i co dalej?




Z przyjemnością zapraszamy na seminarium pt.: „Pomysł, praca, odkrycie naukowe… i co dalej?”, które odbędzie się 26 października (środa) w godz. 10:00 – 12:30 w sali Rady Wydziału Biologii w budynku Colegium Biologiae, Wydział Biologii UWM przy ul. Oczapowskiego 1A.

Celem spotkania jest przybliżenie możliwości płynących ze współpracy, podejmowanej pomiędzy przedstawicielami środowiska akademickiego a firmami biotechnologicznymi. Pragniemy położyć szczególny nacisk na kwestie usprawnienia realizacji projektów badawczo-rozwojowych oraz omówić zagadnienia związane z ochroną własności intelektualnej.

Spotkanie skierowane jest do kierowników i członków grup badawczych Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego. Seminarium dzięki uprzejmości Laboratorium Diagnostyki Molekularnej UWM organizują firmy Selvita S.A. oraz BioCentrum Sp. z o.o.

Program seminarium:
  • 10:00 powitanie uczestników i przedstawienie firm Selvita oraz BioCentrum
  • 10:10 „Outsourcing oznaczeń biologicznych, jako sposób na efektywną realizację projektów badawczo-rozwojowych ” - Magdalena Żabka (BioCentrum Sp. z o.o.)
  • 10:50 przerwa kawowa
  • 11:20 „Od stołu laboratoryjnego do apteki, czyli o komercyjnym potencjale badań naukowych” – przedstawiciel firmy Selvita S.A.
  • 12:00 dyskusja i możliwości rozmowy o prowadzonych projektach
  • 12:30 zakończenie
Będzie nam bardzo miło gościć Państwa na seminarium.

Ze względu na ograniczoną liczbę miejsc wszystkich zainteresowanych uprzejmie prosimy o potwierdzenie obecności do dnia 18 października 2011 (wtorek) poprzez wysłanie maila na adres: magdalena.zabka@biocentrum.com.pl lub telefonicznie: kom. 795 440 029. Z wyrazami szacunku,
Magdalena Żabka

niedziela, 9 października 2011

Dzień Drzewa

Nasi absolwenci sadzą drzewa..., z okazji międzynarodowego Dnia Drzewa. Na zdjęciu mgr Kamila Narewska-Prella (absolwentka biologii), sadząca swoje drzewo w Ostródzie.

Dzień Drzewa wymyślił Amerykanin Juliusz Morton w 1872 roku, anonsując je hasłem „inne święta służą jedynie przypomnieniu, Dzień Drzewa wskazuje zaś na przyszłość”. Jego pomysł spotkał się z szerokim odzewem. Tylko w 1872 roku w USA posadzono ponad milion drzew. W 1951 roku święto Dzień Drzewa zawitało w Europie. Od kilku lat w dniu 10 października obchodzone jest i w Polsce.

St.Cz.

środa, 5 października 2011

Biolodzy blogują

Zakochani w grzybach - to kolejny blog, pisany przez pracowników Wydziału Biologii. Nie trudno się domyśleć, że chodzi o Katedrę Mikologii. To już drugi - po Laboratorium Diangnostyki Molekularnej - dodatkowy (poza niniejszym) blog tworzony na Wydziale Biologii UWM w Olsztynie. Bo ludzie pełni pasji badawczej i ciekawi świata mają o czym pisać i rozszerzać misję uniwersytetu o internetowy e-learning.

A na naszym, ogólnowydziałowym blogu także i w tym roku swoich pisarskich sił próbować będą nasi studenci. Będą opisywać swoje przygody z biologią i biotechnologią.

piątek, 30 września 2011

Mikologia i… hardcore

Co wspólnego ma mikologia z hardcore’m? Ano, jak się okazuje, ma. Do tej pory jeśli zdarzało mi się słyszeć jakieś sądy o nauce o grzybach, to na przykład takie, że mikologia jest ciekawa, fascynująca, albo też trudna. Ale żeby hardcore’owa?! No, na to, to bym w życiu nie wpadła. A takie właśnie komentarze padały z ust pięcioklasistów, jak i pięcioklasistek, którzy zawitali niedawno do naszej katedry na krótkie, acz intensywne warsztaty z różnorodności grzybów podczas Olsztyńskich Dni Nauki. Pierwszy odruch to było święte oburzenie („Jaki hardcore?!”). Widząc jednak zachwyt w oczach dzieciaków, spoglądających w okular mikroskopu świetlnego i powtarzających raz po raz „Ale hardcore!”, dałam spokój z nawracaniem na tory prawdziwej polszczyzny . Tym, co wzbudziło szczery entuzjazm tych jedenastolatków, były zarodniki grzybów Phragmidium mucronatum (gatunek porażający liście róży, zdjęcie u góry) oraz Melampsora larici-populina (występujący na liściach topoli, zdjęcie niżej). Zresztą pięknych grzybów. Choć to piękno nieco zdradliwe, bo oba gatunki należą do groźnych pasożytów niszczących swoich żywicieli.


Jak widać, to, co dla „dorosłych” mikologów jest piękne, dla „małych” mikologów może być nawet hardcore’owe.


Ewa Sucharzewska

(Katedra Mikologii)


Zarodniki typu uredospor Melampsora larici-populina